O medicamento manipulado tem como principal característica a preparação personalizada destinada a determinado usuário que é o portador de prescrição realizada por profissional habilitado, com doses especificadas para cada componente da fórmula, de fácil rastreamento, e sendo atendido pela farmácia de manipulação.
Toda farmácia de manipulação conta com a presença constante de um farmacêutico responsável, que supervisiona todo o processo de produção das fórmulas, desde a chegada da receita, à produção em laboratórios e o controle de qualidade, para que o paciente obtenha um tratamento de maior qualidade.